Kemeraltı Çarşısı’nda bulunan ve 1663 yılında inşa edilen KestanepazarıCamii de 17. yüzyılda yapılan diğer camiler gibi deniz kıyısında yer almaktaydı. Hatta Evliya Çelebi Seyahatname’sinde caminin sağ ve solunun zamanında denizle çevrili olduğunu, ancak bu alanların zamanla dolarak kara hâline geldiğini aktarır. Zaman içerisinde iç limanın dolmasıyla caminin de denizle irtibatı kesilmiştir. Caminin banisi Baruthane-i Amire nazırı Hacı Ahmet Ağa’dır, bundan ötürü Evliya Çelebi Seyahatname’sinde adı Ahmet Ağa Camisi olarak geçmektedir. Bununla birlikte, caminin hangi tarihten itibaren Kestanepazarı Camii olarak anılmaya başlandığına dair bir bilgi herhangi bir kaynakta yer almamaktadır. Şadırvan(altı) Camii ve Başdurak Camii gibi fevkani cami özelliğine sahip Kestanepazarı Cami’nin de zemin katında dükkân ve depolar bulunmaktadır.